虽然木瓜有这么多好处，但是木瓜偏寒性，因此胃寒、体虚者不宜多吃，否则容易腹泻或胃寒。孕妇是不宜食用太过于寒性的食物的。
而且，现代医学研究发现，木瓜中含有的木瓜苷有增加子宫收缩的作用，所以，为了避免意外的流产或早产，孕妇最好不要吃木瓜，无论生熟都不宜吃;因为即便木瓜烧熟了，也不能破坏木瓜苷。
